海藻和许多其它的生物经常会填充珊瑚框架，然后形成环状珊瑚礁，继而形成完成的结构；接着，成千上万的动物、植物、细菌等等，都会聚集在里面。大家都喜欢珊瑚，但即便是从珊瑚上走过，也会对居住在那里的生物造成严重的损害。踩踏珊瑚就等于踩踏有生命的生物。有人听了可能会有些惊讶，因为他们想：“这是石头，怎么会是活的呢？”其实珊瑚是一种或数种成长中的生物。
随着近年来海水的温度升高，珊瑚在渐渐变白。
珊瑚发生白化现象，是由于生活在珊瑚里的植物感到过热，无法进行光合作用。事实上，这时它们会制造一些有毒的化合物，使动物和植物分离。于是，珊瑚便吐出腰鞭毛虫或虫黄藻，然后颜色从棕色、也就是虫黄藻的颜色变成白色，这就叫珊瑚白化。通常澳洲珊瑚的白化发生在厄尔尼诺现象最严重的时期。
这种时候便会出现无风现象。在阳光灿烂的日子里，海洋顶层的水温会迅速上升。我们不敢想象全球变暖带来的严重后果，因为这会使海洋发生极大的改变。如果没有了海洋，我们也就无法生存了。这会导致一种结果，那就是在五十年之内，大堡礁一大半的珊瑚都将消失。
对大堡礁来说，人类的沿海开发是珊瑚礁面临的最大威胁。在规划景区时，如果改变了这个地方的水流和养分的流向，改变了沉积物和漂向珊瑚礁的养分的流向，就会改变珊瑚礁。同时珊瑚礁上进行频繁的捕鱼活动，更会严重影响大堡礁的生态系统。人们需要注意一个事实，那就是数十年来大堡礁的珊瑚礁生态环境都在不断缩小。
